当时的国家十分振奋，立即就展开了星空探索的初步资源准备，然而谁也没想到，就在人类准备整合资源，建造太空飞船，踏入星空的时候，源系统也出现了问题。
由于在系统中增加了人类基因图谱数据，因此源系统在经过深度的分析之后，得出了一个结论：人类这种生物的基因并不完美，如果星空探索计划的主导者是人类，将很有可能会导致探索计划执行失败。
因此，源系统自主诞生了一个新计划——人类取代计划，并在暗地里自主建造所有类型，所有工种的机器人，同时逐步窃取星球主脑壹的部分权限。
最终，在人类所有的准备快要完成，即将踏入星空的时候，源系统也正式启动了人类取代计划，一举直接瘫痪了地球上所有在主脑壹控制权限下的机器，人类被打了个猝不及防，层层溃败。
幸亏人类为了星空探索计划重新开发了一套主控系统——启，利用启系统，人类和源系统打了整整两年，但依然摆脱不了最终战败的局面，不得已，人类决定利用已经建造成功的太空飞船，同时搭载启系统，逃入星空，保留火种。
按照火种保卫计划，选定的人类火种将会被分为七个批次送入太空。前五次已经成功，但最后两次由于源系统增强了进攻力度，导致失败。
人类逃入星空之后，源系统并没有继续追杀，因为它毕竟是基于最初探索星空的目的而打造的一套系统，所以它的核心使命还是探索星空。现在人类已经逃走了，源系统自然而然地成为了星空探索计划的主导方，也就没有必要再对人类穷追猛打了。
就这样人类生存了下来，并联合在一起创建了星盟。
而源系统在之后的四万年间，也将银河系及其周边探索完全，并逐渐发现地球资源不足以支持探索行动向更远更深的星空前进，因此源系统决定放弃地球，整体迁移，一边寻找资源，一边探索星空。
不得不说，当初与源系统战争，掩护火种顺利进入星空的那群人类，有极少部分幸存了下来。由于对源系统的探索计划不存在威胁，源也就没有再针对他们。
经过了四万年夹缝中求生的生活，那一小部分人类已经退化到了原始社会形态，在源系统撤离地球后，他们才开始慢慢地发展壮大，最终形成了现在的地球人。
源系统进入太空后，逐渐地跟星盟的人有了接触，彼此间发生了多次摩擦，这更加坚定了源系统清除人类，防止探索计划失败的信念，于是星盟和源系统的战争便由此展开，一直持续到现在。