此时，已经‘诞生’了思维的主宰被埃蒙赋予了一项新的使命，那就是吸收星灵，成为“完美的存在”（也就是让主宰的虫群化身为带有异虫色彩的“混元体”）。
不过..不甘心任人驱使的主宰切断了和萨尔那加的幽能联系，并偷偷开始了自己的计划，而萨尔那加却毫无察觉。只是观察着宇宙中那些自己的造物，幻想着下一任轮回者的诞生
不久之后，满心怒火的主宰发现了一种太空生物，于是便将它们引诱到行星上。在同化了这种生物后，主宰创造了一种新的飞行虫群，它称它们为利维坦...它们可以生存在太空中。从此以后，异虫的进化不再受泽鲁斯行星的限制了。随后，主宰用这些新的异虫虫群向它的创造者们发动了进攻。虽然萨尔那加积极抵御，但异虫最后还是攻破了萨尔那加的防御体系，无数的萨尔那加人阵亡在了主宰的爪牙之下，化成了主宰进化的肥料
主宰用了数千年的时间将萨尔那加的意识都融入到自己的意识中，这使得异虫得到了很大的进化。在此过程中，主宰获知了凯达林水晶的秘密，并将这些水晶的力量融入到自己体内，使得异虫得到了进一步的进化，主宰的幽能力量达到了完美的境界。然而，吸收了萨尔那加意识的主宰也彻底的..或者说青少年终于诞生出了完全属于自己的意志。虽然它自己的意志弱小不堪，无法拒绝和对抗埃蒙，但是，它还是从萨尔那加的意志之中寻找到了埃蒙真正的目的。而这个目的将最终葬送它和它的虫群。
主宰那弱小的意志开始咆哮和哭喊，但是埃蒙的意志根本无法阻挡。主宰开始暗地里寻求一个抵抗埃蒙的可能，这个可能，是它倾注了所有心血，压上了所有未来的产物...
终于，主宰来到了艾尔行星附近。它发现了附近查尔沙拉行星上的人类，于是它打算也同化人类。在拥有物理和幽能特性后，再去进攻星灵在艾尔强大的防御体系。
于是，它在查尔行星上降落，在同化了当地的人类勘探者之后，它将查尔这个气候恶劣但是适合种群进化的行星作为自己的母星。在搜寻星灵期间，主宰一直致力于寻找对抗埃蒙的可能。不幸中的万幸，它成功了。
在康格鲁星区的新盖茨堡平台，它感染了一个叫莎拉·凯瑞甘的人类女性幽灵，并增强了她原本就很强大的幽能力量。但不幸的是，主宰引起了一个叫泽拉图的星灵的注意，泽拉图率领暗黑圣堂武士来到了查尔行星，意图摧毁主宰。
可是...寻找了数千年，眼看就要收获果实的时候，它怎么可能会放手？！