应天府如此，全国也是如此。大明建国至今，除了东南沿海遭遇过倭寇袭扰，北部边境地区经常遭遇蒙古入侵之外。两百多年来，整个腹心之地并没有什么大的战争、dòng • luàn和瘟疫。可是两百多年下来，万历三十年的黄册显示，全国居然只有5500万人口，比建国初期还要少500多万。
1612年十月一日，朱由栋在南华宫召开总结大会，其幕府成员，所有工作队队长全部参会。
“……得益于诸位的忠诚奉献，本次应天府人口普查工作顺利完成……普查结果，触目惊心。这正说明我们的工作是极有意义的，对于这个国家，这个民族，是极为重要的！接下来，我们要对工作队的人员进行充实、调整。各队要以老带新，培养出更多的队员，轮流交替的在其他各府、各布政司逐步的进行人口普查工作。诸位，这是一份艰辛而长久的工作，随着普查工作的推进，各地的刁民将变得越来越狡猾，越来越善于和诸位对抗。而我们的工作，却会离我们的大本营越来越远，得到军队支持和保护的力度也会越来越小。但是，即便如此，我们也必须坚定的将这项工作持续下去！孤准备用三到五年的时间，切实的完成全国的人口普查，让整个天下在朝廷面前再次透明！诸位，请告诉孤，你们有信心么？”
“愿为殿下效死！大明之天下，必将重新透明！”
……
散会之后，朱由栋刚刚从主位上走下，就看到王承恩拼了命的向自己招手。
“何事如此着急？”
“小爷，魏公公刚刚赶到，千岁爷他，薨了！”广通乡于万历三十九年上报高淳县户籍时，报上人口两千零三十五人，差额一千二百九十人。奉殿下教令，本次清查，只查不惩，臣等已责令高淳县重新登记人口数量。又，经查，广通乡实有举人及以上官绅三户，上户四十六户，中户二百五十八户，下户六百零一户，畸零代管十三户。其中上户改中户，下户改上户等案例，累计三百零五例。奉殿下教令，此等行径需严惩不贷。臣等先后毙杀里长三人，甲长两人，撤换里长七人，甲长一百三十五人。对不履职之乡老，严厉告诫，并进行罚款。累计收入罚金白银一百二十五两零四钱。所有新任甲长、里长、乡老，均由当地村民自行推举。工作队用印后交高淳县衙确认备案。
臣等已按照殿下教令，为每一户重制户口登记簿，为每一人编好身份证号码。所有无户籍之流亡人口，重新登记造册在当地入籍……
两月清查，广通乡总体秩序平稳，除被毙杀之里长、甲长家属闹事，并被迅速镇压外，无一起民变。百姓多踊跃支持，朝南华宫所在遥拜，为太孙祝寿者更是大有人在。现臣等已经完成殿下嘱托，特此汇报，缴令。
人口普查工作总队第二百三十五分队，队长张文华、副队长马燃。
大明万历四十年七月二十九日。”
从1612年的七月下旬开始，朱由栋陆陆续续的接到了各支工作队提交的报告。到了这一年的九月初，四百支工作队全部完成了各自的工作。